Genotypage par sequencage gbs

[Nasser OUATT]

Bonjour, je voudrais savoir si les SNPs permettent de déceler des mutations impliquant les résistances aux insecticides chez les insectes.
Merci
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[minushabens]

sujet à la mode...

la réponse est : pas toujours. On connaît au moins un cas où la résistance est due à la présence dans le génome d'un gène en plusieurs copies au lieu d'une seule. L'insecticide cible une protéine (l'acétylcholinestérase) et la réponse consiste à produire cette protéine en grande quantité, ce qui peut s'obtenir en multipliant les copies du gène qui la code. Dans ce cas les copies du gène sont identiques au gène de l'insecte non résistant et donc on ne voit pas la résistance dans la liste des SNP.

[Nasser OUATT]

Merci pour votre message. Dans mon étude je voudrais déterminer les mécanismes moléculaires (kdr, s-kdr pour les canaux sodium et Ace-1 Ace-2 pour l'acétylcholinestérase) impliquant une résistance aux insecticides. quelles méthodes pourrais-je utiliser?
Merci d'avance.